পুলিশ জানায়, হত্যাকাণ্ডের পর থেকে পুলিশ তদন্ত শুরু করেছে। ওই ফ্ল্যাটে ২০-২২ বছর বয়সী একজন তরুণ ও একজন তরুণীকে ঘিরে সন্দেহ তৈরি হয়েছে। ইতোমধ্যে তাদের গ্রেপ্তার করেছে উত্তরখান থানা পুলিশ। গ্রেপ্তারকৃতরা হলেন নাজের ও রুপা। তারা স্বামী-স্ত্রী।
বিষয়টি নিশ্চিত করে ডিএমপির উত্তরা বিভাগের উপপুলিশ কমিশনার (ডিসি) মো. মুহিদুল ইসলাম বলেন, আজকে ফরিদপুর থেকে তাদের গ্রেপ্তার করা হয়েছে। এই দুইজন স্বামী-স্ত্রী‌‌। গত সাত মাস আগে তাদের বিয়ে হয়েছে। তাদের ফোনের মাধ্যমে পরিচয়, এরপর তারা একে অপরকে বিয়ে করেন। 
তিনি বলেন, আমরা এই হত্যাকাণ্ডের রহস্য উদঘাটনের কাছাকাছি চলে এসেছি। তাদেরকে সন্দেহভাজন হিসেবে গ্রেপ্তার করা হয়েছে। তাদেরকে জিজ্ঞাসাবাদের মাধ্যমে আমরা হত্যাকাণ্ডের প্রকৃত রহস্য বের করতে পারব।
এ বিষয়ে উত্তরখান থানার ভারপ্রাপ্ত কর্মকর্তা (ওসি) মো. জিয়াউর রহমান বলেন, উত্তরখানের পুরান পাড়া এলাকায় ভাড়া বাসায় খুন হন হাবীবুল্লাহ বাহার কলেজের উপাধ্যক্ষ সাইফুর রহমান ভুঁইয়া। ওই ফ্ল্যাটে কয়েকদিন আগে রুপা ও নাজের নামের এই দম্পতি ওঠেন। এরপর সোমবার ভোরে তারাই হত্যাকাণ্ড ঘটিয়ে পালিয়ে যান বলে অভিযোগ রয়েছে। তারা ঢাকা থেকে পালিয়ে ফরিদপুরে আত্মগোপন করেন। এরপর অভিযান চালিয়ে তাদেরকে গ্রেপ্তার করা হয়।
এর আগে সোমবার (১০ মার্চ) ভোরে রাজধানীর উত্তরায় নিজ বাসায় খুন হন সাইফুর রহমান ভূঁইয়া। তাকে দেশীয় অস্ত্র দিয়ে কুপিয়ে জখম করে বাথরুমে আটকে রেখে সটকে পড়ে অপরাধীরা। পরবর্তীতে বাথরুমের দরজা ভেঙে বের হলে প্রতিবেশীরা তাকে উত্তরার একটি হাসপাতালে নিয়ে গেলে মৃত ঘোষণা করা হয়।
ঢাকা মহানগর পুলিশের (ডিএমপি) উত্তরা বিভাগের অতিরিক্ত উপকমিশনার আহমেদ আলী গণমাধ্যমকে বলেন, সাইফুর রহমান ওই ভাড়া বাসায় একাই থাকতেন। কয়েক দিন আগে দুজন নারী-পুরুষ তার বাসায় ওঠেন। আজ সেহরির সময় তাকে ধারালো অস্ত্র দিয়ে আঘাত করা হয়। পরে পুলিশ খবর পেয়ে তাকে উদ্ধার করে স্থানীয় একটি হাসপাতালে ভর্তি করে। সেখানে চিকিৎসকেরা তাকে মৃত ঘোষণা করেন।